姓 名：

李誌

性 别：

男

职 称：

实验师

导师情况：

刘元宁（吉林大学）

学 历：

硕士

办公电话：

13039016988

电子邮箱：

Lizhitang@tom.com

个人简介

主要研究方向是生物信息学，数据库管理，软件工程，近年参与国家自然科学基金1项，省部级项目1项。

2004/01-2006/01，37000vip威尼斯，37000vip威尼斯计算机系，本科

2005/01-2007/12，吉林大学，计算机科学与技术学院 工学硕士

研究领域

1. 生物信息学-RNA二级结构、基因调控

2. 计算机网络-网络架构、系统控制

研究概况

从事RNA领域的研究，提出基于茎区的动态规划和基于改进的蚁群RNA二级结构预测算法，提出了用于计算RNA二级结构能量的平衡能能量模型，并利用这些方法寻求对流感病毒有抑制作用的siRNA结构特征，开发了高效的流感病毒siRNA设计软件；根据miRNA靶基因预测，发现了基于调控流感病毒的miRNA；针对lncRNA，依据结构特征，建立调控网络、确定ncRNA的功能，使一些医学和生物学难题的解决成为可能，并且对药物设计甚至临床治疗起到指导作用。

构建基于靶基因二级结构特征的人-植物靶基因预测模型，使用拟南芥作为植物样本，筛选植物miRNA，利用人类的mRNA和miRNA依据动植物的小RNA高老特征，构建人类-植物的靶基因预测，并对预测结果进行筛选，获得能够被植物miRNA调控的人类mRNA；

建立基于基因权值变化的植物-人基因调控网络，根据基因权值变化，对植物-人基因调控网络中的调控通路进行分析，寻找核心调控通路。

构建基于人体外源性植物miRNA调控机制模型，发现筛选出的植物miRNA与人类的代谢过程关系密切，并从中挖掘出AXIN1、HOXB1、ATP5D、MAPK8IP2等9个核心节点。

饮食习惯可能会由于人体摄入的miRNA的不通导致人体代谢发生变化，从而导致人体生理机能的变化，该结果同欧亚人种的饮食和身体机能的关系是相吻合的。

研究课题

1. 吉林省科技发展计划项目，20150101056JC，“基于基因组学的人体外源性microRNA跨物种调控机制研究” 2015.01-2017.12，10万元，已结题，参加。

2. 国家自然基金面上项目，60971089，“带假结的RNA二级结构预测新方法及其针对流感病毒的反向遗传学应用研究”， 2010.01-2012.12，30万，已结题，参加

奖励与荣誉

2015年吉林省科技进步奖三等奖

学术成果

(1) 李誌, 刘元宁, 张浩, 沈廷杰, 李杰, and 翟洪亮, 基于动态规划 RN A 二级结构的比较.吉林大学学报 (工学版), 2011. 41(Sup 2).(EI检索)

(2) 李誌, 刘元宁, 武泽旭, 常亚萍, 何飞, 徐宝林, and 张浩, 基于动态算法的序列分析.吉林大学学报: 信息科学版, 2010(1): p. 41-46.

(3) 刘元宁, 艾露露, 段云娜, 李誌, 田明尧, and 张浩, 基于局部结构交互的 RNA 假结预测.吉林大学学报: 工学版, 2015(2): p. 613-618. (EI检索)

(4) Liu, Y., Y. Chang, D. Xu, Z. Li, H. Zhang, J. Li, and M. Tian, Optimised design of siRNA based on multi-featured comparison and analysis of H1N1 virus. International journal of data mining and bioinformatics, 2013. 7(4): p. 345-357. (SCI检索)

(5)Liu, Y.-n., H. Dong, H. Zhang, G. Wang, Z. Li, and H.-L. Chen, Prediction of RNA secondary structure based on particle swarm optimization. Chem. Res. Chinese Universities, 2011. 27(1): p. 108-112. (SCI检索)

(6)Zhang Hao(#), Li Zhi, Li Yanpu, Liu Yuanning(*), Liu Junxin, Li Xin, Shen Tingjie, Duan Yunna, Hu Minggang, Xu Dong，A computational method for predicting regulation of human microRNAs on the influenza virus genome[J]. BMC systems biology, 2013, 7(2): S3. (SCI 检索)

(7)刘元宁, 李鑫, 张浩, 沈廷杰, 李誌, 田明尧, and 鲁会军, 调控流感病毒基因片段的人编码 microRNA 的新方法.吉林大学学报: 工学版, 2011. 41(6): p. 1704-1708.

(8) Zhang, H., Z. Li, Y. Liu, Y. Li, Y. Duan, and D. Xu. RNA secondary structure comparison based on dynamic programming. in Computing and Convergence Technology (ICCCT), 2012 7th International Conference on. 2012. IEEE. (SCI检索)

(9) Zhang, H., X. Li, Y. Liu, Z. Li, M. Hu, and D. Xu. Human encoded miRNAs that regulate the inflenenza virus genome. in 2012 IEEE 6th International Conference on Systems Biology (ISB). 2012. IEEE. (SCI检索)